La Biblioteca resguarda el Archivo de la Real Audiencia de la Nueva Galicia instancia que funcionó desde mediados del siglo XVI hasta los inicios de la vida independiente de México en 1824. Dada su trascendencia regional, recientemente dicho archivo también fue aceptado por la UNESCO como parte de la Memoria del Mundo.

 

Otro archivo de sumo valor histórico es el dedicado al Supremo Tribunal de Justicia de Jalisco que recupera parte de la memoria social del estado durante el siglo XIX y principios del XX.

 

Existen también otros archivos, tales como: